Rekening houden met het weer in Mfangano Island is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en maart, met een gemiddelde temperatuur van 21 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 19 °C De maanden met de meeste regen in Mfangano Island zijn april, november, december en mei. Deze maanden valt er gemiddeld 279 mm regen.