De wateren bij Isla Contoy zijn zeer rijk aan voedingsstoffen die dienen als voedsel voor het plankton dat de voedselbasis vormt van meer dan 234 vissoorten die in het gebied zijn geïdentificeerd, waaronder de majestueuze walvishaaien en pijlstaartroggen die zich voeden nabij hun kusten en de schildpadden die nest daar.

Het Ixlaché-rif ten zuiden van Contoy markeert het begin van de op een na langste rifbarrière ter wereld, het Great Mesoamerican Reef. Mooie soorten koralen, vissen en organismen van grote commerciële waarde, zoals langoesten en roze slak, zijn er in overvloed.
Zwem met roggen en schildpadden, verpleegsterhaaien en een enorme hoeveelheid vis.