Leonardo's meesterwerk, het Laatste Avondmaal, een van 's werelds grootste geschilderde meesterwerken, bevindt zich op de achterwand van de vorige refter van het vijftiende-eeuwse Domenicaanse klooster. Geschilderd door Leonardo tussen 1495 en 1498 beeldt de apostelen af die samen met Jezus zaten toen Jezus aankondigde dat een van hen hem zou verraden. De emotie van de Discipelen komt tot uiting in hun gebaren, bewegingen en gezichten en contrasteert met de schijnbare onbeweeglijkheid van Christus die het centrum van een rigoureus symmetrische compositie in perfect perspectief domineert. Het schilderij was op wonderbaarlijke wijze onaangetast door de bombardementen in augustus 1943 die het nabijgelegen klooster en een deel van de kerk beschadigden.