Rekening houden met het weer in Algodão de Jandaíra is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk november en december, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C. De koudste maanden zijn augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 22 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Algodão de Jandaíra is 491 mm.