Je voorbereiden op het weer is een goede manier om je reis naar Ambon tot een succes te maken, vooral als het een beetje meer mag zijn. De warmste maanden zijn gewoonlijk juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 18 °C. De koudste maanden zijn februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 8 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Ambon is 792 mm.