Een idee hebben van de weersverwachtingen in Atlixco, is belangrijk als je je reis plant. De warmste maanden zijn gewoonlijk april en maart, met een gemiddelde temperatuur van 19 °C. De koudste maanden zijn januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 16 °C De maanden met de meeste regen in Atlixco zijn september, juni, augustus en juli. Deze maanden valt er gemiddeld 329 mm regen.