Rekening houden met het weer in Bantonan kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en juni, met een gemiddelde temperatuur van 27 °C. De koudste maanden zijn februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C De maanden met de meeste regen in Bantonan zijn juli, september, augustus en juni. Deze maanden valt er gemiddeld 476 mm regen.