Rekening houden met het weer in Canutama kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn juni en juli, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Canutama zijn maart, januari, februari en december. Deze maanden valt er gemiddeld 385 mm regen.