Rekening houden met het weer in Challabamba kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk oktober en november, met een gemiddelde temperatuur van 11 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 9 °C De maanden met de meeste regen in Challabamba zijn februari, december, januari en maart. Deze maanden valt er gemiddeld 350 mm regen.