Rekening houden met het weer in El Pantano kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 16 °C. De koudste maanden zijn januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 15 °C De maanden met de meeste regen in El Pantano zijn april, mei, oktober en maart. Deze maanden valt er gemiddeld 360 mm regen.