Rekening houden met het weer in Goshokage Onsen is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 18 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van -4 °C De maanden met de meeste regen in Goshokage Onsen zijn juli, augustus, september en oktober. Deze maanden valt er gemiddeld 240 mm regen.