Rekening houden met het weer in Isla de Coiba kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk maart en april, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 27 °C De maanden met de meeste regen in Isla de Coiba zijn augustus, mei, juli en oktober. Deze maanden valt er gemiddeld 554 mm regen.