De beste plek om te verblijven in Jaffna is over het algemeen rond het stadscentrum, met name in de buurt van het Jaffna Fort of langs de belangrijkste doorgaande wegen zoals Hospital Road en Kandy Road.Dit centrale gebied biedt het meeste gemak voor bezoekers. Hotels hier zijn doorgaans binnen handbereik van belangrijke bezienswaardigheden, winkels en restaurants, waardoor het eenvoudig is om te voet of met een korte tuktuk-rit te verkennen. U vindt hier veel van de belangrijkste attracties van de stad, zoals de Jaffna Public Library en de Nallur Kandaswamy Temple, die gemakkelijk bereikbaar zijn vanuit dit knooppunt.Voor stellen biedt een verblijf nabij Jaffna Fort een aangename uitvalsbasis. Dit historische fort, met zijn Nederlandse historische architectuur, is een belangrijk herkenningspunt en geeft een gevoel van het verleden van de stad. De omgeving biedt vaak hotels met goede voorzieningen en een relatief rustige sfeer, terwijl het toch dicht bij eetgelegenheden en culturele bezienswaardigheden ligt.Soloreizigers zullen de praktische bruikbaarheid van een verblijf dicht bij het centrale busstation of treinstation waarderen, die beide in het centrum liggen. Dit maakt verder reizen eenvoudig en biedt snelle toegang tot lokaal vervoer voor het verkennen van de omgeving.