Rekening houden met het weer in Juan Santiago is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 24 °C. De koudste maanden zijn januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 21 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Juan Santiago is 921 mm.