Je voorbereiden op het weer is een goede manier om je reis naar Labuan tot een succes te maken, vooral als het een beetje meer mag zijn. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en juni, met een gemiddelde temperatuur van 27 °C. De koudste maanden zijn februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Labuan zijn november, december, januari en oktober. Deze maanden valt er gemiddeld 288 mm regen.