Rekening houden met het weer in Limboto kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk oktober en maart, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C. De koudste maanden zijn september en juli, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Limboto zijn april, november, december en januari. Deze maanden valt er gemiddeld 333 mm regen.