Rekening houden met het weer in Los Junquillos is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 18 °C. De koudste maanden zijn juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 11 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Los Junquillos is 493 mm.