Rekening houden met het weer in Malinao is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en juni, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Malinao zijn december, juli, oktober en januari. Deze maanden valt er gemiddeld 322 mm regen.