De beste tijd om naar Megisti te gaan is tijdens de schouderseizoenen van mei, begin juni, september en begin oktober.Gedurende deze maanden is het weer aangenaam warm, ideaal om te zwemmen en het eiland te verkennen zonder de intense hitte van midden in de zomer. U zult merken dat het eiland minder druk is dan in juli en augustus, wat zorgt voor een meer ontspannen ervaring bij archeologische vindplaatsen en lokale tavernes. Vlieg- en veerdiensten zijn regelmatig, wat zorgt voor gemakkelijk reizen.Voor degenen die van een levendige optie houden en hogere temperaturen niet erg vinden, bieden juli en augustus de volledige zomerervaring met alle diensten volledig operationeel en een bruisende haven. Dit is het hoogseizoen voor velen, met volop mogelijkheden voor boottochten en avondactiviteiten. Hoewel het drukker is, behoudt Megisti zijn charme, en de warme avonden zijn uitstekend voor dineren in de buitenlucht.Reizigers die op zoek zijn naar een rustige ontsnapping kunnen eind april of eind oktober overwegen. Het weer kan iets koeler zijn, maar het eiland is erg rustig en biedt een inkijkje in het lokale leven buiten het belangrijkste toeristenseizoen.