Je voorbereiden op het weer is een goede manier om je reis naar Minamioguni tot een succes te maken, vooral als het een beetje meer mag zijn. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 20 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 3 °C De maanden met de meeste regen in Minamioguni zijn juni, juli, augustus en september. Deze maanden valt er gemiddeld 357 mm regen.