Rekening houden met het weer in Morro da Cruz is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C. De koudste maanden zijn juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 20 °C De maanden met de meeste regen in Morro da Cruz zijn januari, februari, maart en december. Deze maanden valt er gemiddeld 270 mm regen.