Rekening houden met het weer in Navegantes kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 24 °C. De koudste maanden zijn juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 17 °C De maanden met de meeste regen in Navegantes zijn januari, februari, maart en december. Deze maanden valt er gemiddeld 205 mm regen.