Je voorbereiden op het weer is een goede manier om je reis naar Ngapali tot een succes te maken, vooral als het een beetje meer mag zijn. De warmste maanden zijn gewoonlijk april en mei, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C De maanden met de meeste regen in Ngapali zijn juli, juni, augustus en september. Deze maanden valt er gemiddeld 789 mm regen.