Rekening houden met het weer in Panafidino is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 16 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van -7 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Panafidino is 661 mm.