Rekening houden met het weer in Puerto Pizarro is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en maart, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C. De koudste maanden zijn augustus en september, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Puerto Pizarro is 759 mm.