Het weer speelt waarschijnlijk een grote rol als je je reis plant naar San Pedro. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 16 °C De maanden met de meeste regen in San Pedro zijn januari, februari, december en maart. Deze maanden valt er gemiddeld 255 mm regen.