Rekening houden met het weer in São Francisco do Conde is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en maart, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C. De koudste maanden zijn augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C De maanden met de meeste regen in São Francisco do Conde zijn mei, april, juni en juli. Deze maanden valt er gemiddeld 185 mm regen.