Rekening houden met het weer in São João do Itaperiú kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 24 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 17 °C De maanden met de meeste regen in São João do Itaperiú zijn januari, februari, maart en december. Deze maanden valt er gemiddeld 222 mm regen.