Rekening houden met het weer in Secretario is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 22 °C. De koudste maanden zijn juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 18 °C De maanden met de meeste regen in Secretario zijn december, november, januari en maart. Deze maanden valt er gemiddeld 318 mm regen.