Je voorbereiden op het weer is een goede manier om je reis naar Tarapoto tot een succes te maken, vooral als het een beetje meer mag zijn. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 24 °C De maanden met de meeste regen in Tarapoto zijn maart, april, februari en mei. Deze maanden valt er gemiddeld 261 mm regen.