Het weer speelt waarschijnlijk een grote rol als je je reis plant naar Yamakawa Onsen. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 20 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 3 °C De maanden met de meeste regen in Yamakawa Onsen zijn juni, juli, augustus en september. Deze maanden valt er gemiddeld 357 mm regen.