Rekening houden met het weer in Zoquiapan kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en april, met een gemiddelde temperatuur van 19 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 14 °C De maanden met de meeste regen in Zoquiapan zijn september, augustus, juni en juli. Deze maanden valt er gemiddeld 322 mm regen.