Rekening houden met het weer in Bagan Nakhoda Omar kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en juni, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 27 °C De maanden met de meeste regen in Bagan Nakhoda Omar zijn november, december, oktober en april. Deze maanden valt er gemiddeld 297 mm regen.