Rekening houden met het weer in Mollebaya kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en oktober, met een gemiddelde temperatuur van 15 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 14 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Mollebaya is 360 mm.