Rekening houden met het weer in Pengkalan Kubor is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk mei en juni, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn februari en januari, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Pengkalan Kubor zijn december, november, januari en oktober. Deze maanden valt er gemiddeld 361 mm regen.